鱼病知识：抗菌肽分类 |
| 出处：水生动物健康评估 作者： 中文资源在线官网网 2019-01-21 11:04:00 |
抗菌肽，因其天然的抗菌、抗病毒等活性而逐渐引起大家的重视，特别是在“耐药”频发的年代，甚至有文章描述抗菌肽有取代抗生素的潜力，今天小编给大家分享一下来源于抗菌肽数据库中对抗菌肽的分类：
1、基于合成方式分类
天然抗菌肽可分为基因合成和非基因合成，抗菌肽数据库最初只关注于基因合成类抗菌肽，也被称为真抗菌肽。但目前一部分非基因合成类抗菌肽已经在临床上得以应用，如多粘菌素、短杆菌肽、达托霉素。
2、基于生物来源分类
基于生物来源，抗菌肽分为细菌性抗菌肽、植物性抗菌肽、动物性抗菌肽。细菌性抗菌肽来源于细菌，来源于革兰氏阳性菌的抗菌肽可分为以下几类：I型，多肽链合成后发生化学性修饰，又细分为A型和B型，A型具细长结构，B型具球形结构；II型，多肽链合成后未经修饰，又细分为a、b、c、d型；III型，是具有裂解作用的大分子蛋白。来源于革兰氏阴性菌的抗菌肽称为microcins，根据分子量大小分为3种：I型（<5kDa）、II型（5-10kDa）、III型（>10kDa）。动物性抗菌肽又分为昆虫抗菌肽、两栖类抗菌肽、鱼类抗菌肽、爬虫类抗菌肽、哺乳类抗菌肽，其中基于来源家族不同，研究较为广泛的是cathelicidins, defensins, histatins。
3、基于生物功能分类
基于抗菌肽的生物学功能可分为以下类型：抗菌肽（2565种）、抗生物膜肽（38种）、抗甲氧西林金黄色葡萄球菌肽（138种）、抗病毒肽（186种）、抗HIV肽（109种）、抗真菌肽（1090种）、抗虫肽（103种）、抗疟肽（25种）、抗原生动物肽（4种）、抗癌/肿瘤肽（224种）、抗氧化肽（23种）、趋向肽（60种）、杀虫肽（33种）、蛋白抑制肽（28种）、杀精肽（13种）、表面固定肽（47种）、伤口愈合肽（19种）、抗毒肽（14种）、离子通道抑制肽（5种）、消炎肽（12种）。
4、基于肽的性能分类
在缺乏3D结构信息时，抗菌肽基于其电荷、疏水性、氨基酸组成、长度等性能分类。基于氨基酸组成，称为富含某氨基酸抗菌肽，如Trp-rich AMPs（富含色氨酸抗菌肽）。基于电荷可分为正电、中性、负电抗菌肽。基于疏水性可分为疏水性、两性、亲水性抗菌肽。基于抗菌肽的大小（即氨基酸的数目）可分为超短抗菌肽（2-10个氨基酸）、短抗菌肽（10-24个氨基酸）、中等抗菌肽（25-50个氨基酸）、长抗菌肽（50-100个氨基酸），氨基酸个数大于100个称为抗菌蛋白。
5、基于共价键模式分类
基于共价键模式分类是抗菌肽分类的通用系统，可分为以下4类：
（1）UCLL型：线性单一肽链或者两个不通过共价键连接的线性肽
（2）UCSS型：支链-支链相连肽
（3）UCSB型：支链-主链相连多肽
（4）UCBB型：多肽N端和C端相连成一环状肽
6、基于3D结构分类
基于抗菌肽二级结构可分为α，β，αβ和 non-αβ 4种类型，α螺旋结构、β折叠结构、α螺旋+β折叠结构、无α螺旋和β折叠结构。
7、基于分子靶点分类
基于抗菌肽作用的分子靶点，可分为作用于细胞表面抗菌肽、作用于细胞内抗菌肽。
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